RNA剪接（RNA splicing）是指從DNA模板鏈轉錄出的最初轉錄產物中除去內含子，并將外顯子連接起來形成一個連續(xù)的RNA分子的過程。

RNA剪接機制的研究 ，是80年代生物化學和分子生物學領域中最有生機的研究課題之一，它不僅解決不連續(xù)基因轉錄產物的剪接問題，而且對于了解不連續(xù)基因的起源乃至整個生命起源與進化問題都是有力的推動。

另外，核酸分子的催化功能的發(fā)現拓寬了人們對于酶的認識。

造血干細胞發(fā)生過程中的RNA可變剪接

近日，發(fā)表在《Science Advances》上的一篇名為：“Single-cell architecture and functional requirement of alternative splicing during hematopoietic stem cell formation”的文章，揭示了造血干細胞發(fā)生過程中的RNA可變剪接。

第一個造血干細胞(HSCs)產生于哺乳動物胚胎發(fā)育期間的主動脈-性腺-中腎(AGM)區(qū)域。血統追蹤和實時體內觀察表明，造血干細胞來自于造血內皮細胞(HECs)，這是一種沿背主動脈腹壁的短暫群體。

最近，這些細胞被分離出來，并以單細胞轉錄組學為基礎，繪制了小鼠HSC發(fā)育全程的RNA剪接圖譜，并對內皮細胞向造血細胞的轉變（EHT）過程中，出現的關鍵可變剪接（alternative splicing, AS）及其上游調控因素進行探究，鑒定出Srsf2因子——通過調控造血細胞特異性AS事件促進HSC發(fā)生的新機制。

結果1

從AS角度解析T1 pre-HSC所呈現的尤為顯著的轉錄本多樣性：

• AS頻率在T1 pre-HSC時期到達dian峰，與顯著的轉錄本多樣性一致。

結果2

EHT期間轉錄異構體豐度的功能相關差異：

• 84%的HEC和73%的T1 pre-HSC特征亞型(signature isoforms)是蛋白質編碼轉錄本，負責各種RNA代謝過程相關功能。

結果3

一系列AS事件介導了EHT中的轉錄多樣性：

• 與AECs相比，“剪接體”途徑的基因表達在HEC中更為豐富。

結果4

血源特異性包括AS事件是可在體內檢測到的，是體外造血細胞生成所必需的。

結果5

Srsf2在內皮階段的缺失會破壞EHT。

結果6

Srsf2協調造血特異性AS事件：

• Srsf2通過調節(jié)EHT過程中關鍵基因的剪接模式，從而在HSC發(fā)生中發(fā)揮作用。

這項研究中，用到了RNA FISH、qPCR等高精度分子實驗，這些實驗比較容易收到外源DNA、RNA的干擾，因此，為了保證實驗的準確性，如何祛除外源干擾，十分關鍵。

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